ACEDB日本語ガイド(Ver.1.3)

佐野 亨
ＮＥＣ基礎研究所
（sano@exp.CL.nec.co.jp, URL="http://www.cbi.or.jp/￣sano/"）

1996.1.20.

• Contents
• 1 はじめに（著作権等）
• 2 ACEDBについて
  • 2.1 ACEDBとは
  • 2.2 どんなACEDBデータベースファミリーが存在しているか
  • 2.3 最新バージョン等について
  • 2.4 ACEDBについての情報源
  • 2.5 ACEDBワークショップ
• 3 どうしたらACEDBが利用できるようになるのか？
  • 3.1 WWWブラウザを利用する方法
  • 3.2 X端末を使って公開サーバへアクセスする方法
  • 3.3 マッキントッシュを利用する方法
  • 3.4 UNIX+X11を利用する方法
  • 3.5 利用環境が用意できたら
• 4 ACEDBの使用法
  • 4.1 最初の一歩
    • 4.1.1 用語
    • 4.1.2 マウスの使用
    • 4.1.3 ACEDBクラスウィンドウ（メインウィンドウ）
  • 4.2 遺伝地図
  • 4.3 物理地図
  • 4.4 クローングリッドウィンドウ
  • 4.5 シーケンス表示
  • 4.6 ＤＮＡ解析ウィンドウ
  • 4.7 問い合わせウィンドウ
• 5 ACEDBの構文定義
  • 5.1 ACEDBのデータモデル
    • 5.1.1 BNF記法について
    • 5.1.2 ACEDBデータモデル
    • 5.1.3 ACEDBモデルに対するBNF記法
    • 5.1.4 プリプロセッサ
    • 5.1.5 その他の規則
  • 5.2 ACEDB問い合わせ言語
    • 5.2.1 イントロダクション
    • 5.2.2 ターゲットのセット
    • 5.2.3 アクティブなオブジェクトとノード
    • 5.2.4 微細条件
    • 5.2.5 コマンドファイル
    • 5.2.6 データの抽出
    • 5.2.7 ACEDB問い合わせ言語のためのＢＮＦ文法
    • 5.2.8 プリプロセッサ
    • 5.2.9 付加規則
  • 5.3 aceファイルのメカニズム
    • 5.3.1 記述
    • 5.3.2 aceアップデート言語に対するBNF記法
    • 5.3.3 プリプロセッサ
    • 5.3.4 付加規則
• 6 おわりに
• 謝辞
• 7 参考文献とサイト
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